甘肃中医药大学档案文博馆是我国传统文化和中医药文化展示、传播和普及的平台，同时也是中医药文物研究的重要基地。
档案业务用房面积800平米，达到了档案库房、阅档、办公三室分开的要求。全校档案除人事、学生档案外实行集中统一管理，按照高校档案实体分类法将馆藏分为党群、行政、教学、科研、外事、出版、基建、设备、财会、声像十大类，纸质、电子、实物等各类载体档案门类齐全、结构合理。截止2023年12月，馆藏档案96048件（卷）、资料348册、实物149个、纸质照片4551张、电子照片142958张、视频466小时，录像带649盒、光盘75张。近年来，结合校庆、国际档案日等重要时间节点，先后举办“档案 我们共同的记忆”“档案见证小康路、聚焦扶贫决胜期”“喜迎二十大 档案颂辉煌”及“档案话百年”为主题的庆祝建党百年暨“国际档案日”宣传活动等，“恰同学少年 风华正茂”毕业生合影展，通过系列活动的开展，既打造了一专多能、甘于奉献的档案馆员队伍，也培育了富有特色的档案文化，为提升学校文化软实力、更好地服务大学文化传承创新提供助力。
文博展馆始建于1986年，由中国医学史馆、中药标本馆、敦煌医学馆、藏医药馆等4个主要展馆组成，展出面积3000余平方米，共展出标本、模型、图片近4000件。1993 年，敦煌医学馆、中国医学史馆、中药标本馆获得全国普通高等院校优秀教学成果二等奖、省级一等奖，1999 年被中共中央宣传部、教育部、科技部、中国科协评为“全国青少年科技教育基地”，2004 年被中共甘肃省委宣传部评为“甘肃省爱国主义教育基地”，同年，被中共甘肃省委宣传部、省教育厅、省科技厅、省科协评为“甘肃省科普教育基地”。2006年被评为“兰州市科普教育基地”。展馆承担着学校新生入学教育、校友参观、新入职教师培训、社会实践、主题研学和学校重要参观的接待工作，展示了传统中医药学、敦煌中医药学和藏医药学的独特风貌和内涵，搭建起了从理论到形象,从经文到壁画的“形象医学”交流展示平台。场馆突出中医药文化传播的“窗口效应”，向社会免费开放，开展科普教育、爱国主义教育和社会实践教学。通过厚重的中医药文化，打造别开生面的“大思政课”。